公共科研平台为济宁医学院对校内外开放共享的科研平台，拥有完善的仪器设备和先进的实验条件。其建设模式采用单元化管理，依据不同学科和技术特点设立不同的分平台。

  主要包括：生物化学实验室、细胞生物学实验室、分子生物学实验室、大型仪器室等科研平台。生物化学实验室主要从事分子生物学、生物化学、微生物学等方向的研究；细胞生物学实验室可以进行常见细胞肿瘤细胞、成纤维细胞、血管内皮细胞、肾小管上皮细胞等的培养；分子生物学实验室主要从事癌症分子生物学与基因工程、分子与细胞代谢、免疫等方向的研究。大型仪器室集中了公共科研平台100万元以上的大型仪器设备：BD FACS AriaIII分选型流式细胞仪、Leica TCS-SP8激光扫描共聚焦显微镜、膜片钳与离子成像系统、场发射环境扫描电镜、电感耦合等离子体质谱仪、全自动倒置荧光显微操作系统、GE DeltaVision Elite活细胞工作站系统。

  公共科研平台拥有高水平、专业化的技术队伍，为校内外的教学单位、科研机构等提供技术服务，充分发挥设备资源共享效益、避免仪器设备的重复购置和浪费。除大型仪器外，各实验室及仪器均免费对外开放，校内外师生均可申请使用。大型仪器采用收费使用原则，需在济宁医学院大型仪器智能管理系统预约后方可使用。

  公共科研平台是高水平的的综合性医学和生命科学科研实验共享平台，是校内外师生科研的基地，为实现“特色鲜明、国内知名的应用型现代医药科技大学”提供强有力的条件支撑，为校内外教学科研提供高质量的服务。